Capaian Pembelajaran Lulusan Program Studi Sarjana Pendidikan Agama Islam UIN Sunan Kalijaga, terdiri dari 11 capaian, yaitu:

1. Mampu menganalisis konsep-konsep dasar agama Islam dengan menerapkan pemikiran logis, kritis, sistematis, dan inovatif yang mencerminkan nilai-nilai religi, kemanusiaan, moral, dan etika secara mendalam dan jelas.
2. Mampu merancang, melaksanakan, dan mengevaluasi proses pembelajaran Pendidikan Agama Islam yang efektif dan terukur serta mampu mendorong siswa untuk mandiri, bertanggung jawab, dan berakhlakul karimah.
3. Mampu menguasai konsep teoritis bidang Pendidikan Agama Islam (Al-quran Hadis, Akidah akhlak, Fikih, SKI) yang mendalam, terintegrasi dengan multidisiplin ilmu dan mampu menunjukkan sikap religius dalam kehidupan sehari-hari.
4. Mampu mengaplikasikan teknologi informasi dan komunikasi (TIK) dalam mengembangkan perangkat pembelajaran dan bahan ajar yang interaktif dan inovatif dengan menginternalisasi nilai, norma, dan etika akademik.
5. Mampu menunjukkan sikap profesionalisme yang tinggi dalam memberikan pelayanan yang berkualitas kepada masyarakat dengan pemahaman yang mendalam terkait Pendidikan Agama Islam, penguasaan materi ajar yang komprehensif, serta penerapan metode pengajaran yang sesuai untuk meningkatkan kualitas pembelajaran.
6. Mampu menelaah berbagai permasalahan dan memberikan petunjuk dalam memilih berbagai alternatif solusi secara mandiri atau kelompok, sosial dan lintas budaya secara mendalam yang berkaitan dengan Pendidikan Agama Islam serta membangun dan menunjukkan sikap menghargai keanekaragaman budaya, pandangan, agama, dan kepercayaan.
7. Mampu menelaah dan mengembangkan kurikulum pendidikan agama Islam yang responsif terhadap dinamika sosial dan kebijakan pendidikan yang beragam.
8. Mampu merangkaikan ilmu Pendidikan Agama Islam dengan pemikiran logis, kritis, dan sistematis serta bahasa yang ilmiah-komunikatif dan global. Mampu menyelaraskan nilai, norma, dan etika akademik dalam proses pembelajaran serta mampu mempraktikkan keterampilan mengajar secara efektif.
9. Mampu merancang edupreneurship yang kreatif, kritis, komunikatif, dan kolaboratif, dengan berpegang pada nilai-nilai pendidikan Agama Islam, semangat kemandirian dan kejuangan, serta membangun dan mengembangkan jejaring kerja di tingkat nasional maupun internasional.
10. Mampu mengintegrasikan pengetahuan akademik dengan nilai-nilai keislaman dan kemanusiaan serta menerapkannya dalam analisis isu-isu sosial, budaya, dan sains dengan tujuan untuk memberikan kontribusi positif terhadap masyarakat dan lingkungan.
11. Mampu menggunakan bahasa Indonesia secara efektif dalam berbagai konteks komunikasi, serta memahami dan menerapkan nilai-nilai Pancasila dalam kehidupan sehari-hari, sebagai dasar untuk berpartisipasi aktif dalam masyarakat dan berkontribusi terhadap pembangunan bangsa yang berkeadilan dan berkeadaban.